Антикоррупционная работа в министерстве организована в соответствии с Конституцией Российской Федерации, федеральными законами, актами Президента Российской Федерации, Правительства Российской Федерации, международными договорами Российской Федерации, нормативными правовыми актами Министерства обороны Российской Федерации.
В этой связи создана система противодействия коррупции и профилактики коррупционных и иных правонарушений:
сформирована и совершенствуется ведомственная нормативная правовая база в данной сфере;
реализуется План противодействия коррупции в Вооруженных Силах Российской Федерации, которым определены задачи по профилактике коррупционных правонарушений;
создан Совет при Министре обороны Российской Федерации по противодействию коррупции, координирующий деятельность органов военного управления по предупреждению коррупционных правонарушений и выработке мер, направленных на выявление и устранение причин и условий, порождающих коррупцию в Вооруженных Силах Российской Федерации;
организовано взаимодействие с правоохранительными и иными государственными органами по вопросам противодействия коррупции, проведения проверочных и других мероприятий;
используются информационные ресурсы для предупреждения и профилактики коррупции, формирования антикоррупционного сознания военнослужащих и гражданского персонала (государственных гражданских служащих и работников, замещающих на основании трудовых договоров должности в организациях, созданных для выполнения задач, поставленных перед Министерством обороны Российской Федерации);
проводится предметная работа с обращениями граждан, оперативно принимаются меры реагирования;
осуществляются в соответствии с законодательством проверочные мероприятия в отношении военнослужащих и государственных гражданских служащих;
функционирует механизм внутриведомственного контроля;
заслушиваются на заседаниях Комиссии Минобороны России по соблюдению требований к служебному поведению и урегулированию конфликта интересов (аттестационных комиссиях), должностные лица, допустившие нарушения законодательства по противодействию коррупции, а также рассматриваются различные вопросы антикоррупционной тематики.